阳光杀菌法 利用七八月份的温室大棚闲置期，浇足水分，用地膜和大棚膜双层覆盖，连续晒7～10天，土壤中的温度能达到50℃左右，可杀死大部分病菌，减轻土传病害的危害。
客土法 温室耕作层换土，虽费时费工，但是行之有效的好方法，少数农户已采用也证实了这一点。

嫁接换根法 西瓜、黄瓜、茄子都可以用嫁接换根的方法来解决连作障碍。西瓜用葫芦或黑子南瓜、黄瓜用黑子南瓜、茄子用日本野茄子或澳大利亚野茄子。但西瓜嫁接常常降低品质，不好吃。黄瓜老用一种砧木嫁接，连作多年，也会死苗。

生物法 应用生物技术防治土传病害是解决连作障碍最理想的方法。目前正在试验推广的生物技术有许多种：一是抗生菌蘸根法。二是生鸡粪加微生物活化剂闷棚法。亩施鸡粪8000斤，地面喷施土壤活化剂800～1200毫升，翻耕覆盖，浇水覆膜，利用鸡粪发酵产生的热，温度可达60℃～78℃高温，杀死病菌；时间要视天气情况进行20～30天。三是生物肥+鸡粪或优质有机肥+美地那土壤活化剂。第三种生物法的做法如下：

        定植前10～15天整地，亩施鸡粪（腐熟好的）8000斤或优质有机农家肥10000斤，生物肥(侧孢霉生物肥或酵素菌生物肥100～200斤)，氮、磷、钾复合肥若干，微量元素适当，均匀撒在地面，再用土壤活化剂300～600毫升稀释200～300倍地表喷雾，翻耕耙盖，如墒情不足要浇水，10～15天后定植。定植时用抗生菌蘸根，定植后用活化剂稀释液，逐棵浇水压苗。每亩用活化剂原液450～800毫升稀释300倍。